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Ficha CTI Vitae
VALDIVIA RODRIGUEZ HUGO OSWALDO

Mis líneas de investigación se enfocan al estudio y caracterización genómica de parásitos importantes en salud pública con los objetivos de comprender los mecanismos de interacción parásito-hospedador, adaptaciones específicas de estos organismos y generar datos que contribuyan al diagnóstico, desarrollo de vacunas y vigilancia. Mis investigaciones y entrenamiento académico me han proporcionado capacidades en las áreas de genómica, bioinformática y biología molecular mientras que mi desarrollo profesional me ha dado experiencia en la obtención de financiamiento, escritura de publicaciones, establecimiento de una red de colaboradores y ejecución de proyectos. Durante mis estudios de graduación en biología en la UNSAAC y posteriormente como asistente de investigación del U.S Naval Medical Research Unit Six (NAMRU-6), estuve involucrado en investigaciones en enfermedades tropicales como malaria y leishmaniosis. En el área de leishmaniosis trabajé en aislamiento y cultivo de parásitos, uso de biología molecular para diagnóstico y detección de vectores putativos en áreas endémicas de Perú. Como estudiante de doctorado de la UFMG bajo la orientación de la Dra. Daniella Bartholomeu, adquirí nuevas habilidades conceptuales y técnicas en genómica de parásitos y estudios funcionales. Adicionalmente, durante este tiempo aprendí a manejar los lenguajes de programación Perl, Python y R; presentar mis resultados en múltiples conferencias internacionales y expandir mi red de contactos. Actualmente me encuentro involucrado en diferentes proyectos de genómica de malaria y leishmania.

Fecha de última actualización: 07-09-2023
 
Código de Registro:   P0010103
Ver:   Ficha Renacyt


Scopus Author Identifier: 56712506100
Fecha:  30/01/2018

Datos Personales

    Fuente
Apellidos : VALDIVIA RODRIGUEZ
Nombres: HUGO OSWALDO
Género: MASCULINO
Nacionalidad: PERÚ

Datos Actuales

Pagina web personal: http://
Pais de residencia: Perú

Experiencia Laboral

Institución Cargo Descripción del cargo Cargo en I+d+i Fecha Inicio Fecha Fin
CENTRO DE INVESTIGACIÓN DE ENFERMEDADES TROPICALES DE LA MARINA DE LOS EEUU (NAMRU-6) INVESTIGADOR Coordinación de proyectos de investigación Director/Jefe de Gestión de la Investigación Enero 2018 A la actualidad
UNIVERSIDAD PERUANA CAYETANO HEREDIA COORDINADOR ACADEMICO Mis actividades involucran brindar soporte académico al programa de maestría y doctorado en Investigación Epidemiologica participando en la organizacion del plan academico, participacion en el curso de Investigacion Otros cargos relacionados a (I+D+i) Octubre 2016 Enero 2018
ASOCIACION BENEFICA PRISMA GENOMICS SCIENTIST Mis actividades incluyen realizar las labores de supervisión de personal y ejecución de proyectos, elaboración de presupuestos, presentación de proyectos de investigación así como ejecución de análisis de bioinformática y genómica. Director/Jefe de Gestión de la Investigación Julio 2016 Enero 2018
CENTRO DE INVESTIGACIÓN DE ENFERMEDADES TROPICALES DE LA MARINA DE LOS EEUU (NAMRU-6) ADJUNCT SCIENTIST Bajo el cargo de investigador adjunto me ocupo de establecer proyectos de colaboracion, escribir y ejecutar proyectos de investigacion, asi como otras actividades de laboratorio. Julio 2012 Octubre 2015
CENTRO DE INVESTIGACIÓN DE ENFERMEDADES TROPICALES DE LA MARINA DE LOS EEUU (NAMRU-6) ASISTENTE DE INVESTIGACION Como asistente de investigacion me ocupaba de colaborar en el planeamiento, presentacion y ejecucion de proyectos. Asi mismo trabajaba en el diagnostico molecular de Leishmania y otros parasitos Abril 2011 Mayo 2012

Experiencia Laboral como Docente

Institución Tipo Institución Tipo Docente Descripción del cargo Fecha Inicio Fecha Fin

Experiencia como Asesor de Tesis

Universidad Tesis Tesista(s) Repositorio Fecha Aceptación de Tesis

Experiencia como evaluador y/o formulador de proyectos

Tipo de experiencia Ańo Tipo de proyecto Entidad financiadora Nombre del concurso Metodología de evaluación Monto proyecto (USD)
Experiencia como formulador(sólo proyectos ganados) 2014 Otros U.S. DOD Global Emerging Infections Surveillance and Response System 130000.0

Formación Académica (Fuente: SUNEDU)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fuente
LICENCIADO / TÍTULO BIOLOGO UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN ANTONIO ABAD DEL CUSCO PERÚ
BACHILLER BACHILLER EN CIENCIAS BIOLOGICAS UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN ANTONIO ABAD DEL CUSCO PERÚ

Formación Académica (Fuente: Manual)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fecha de inicio Fecha fin Fuente
DOCTORADO DOCTOR EN BIOINFORMATICA UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS BRASIL Mayo 2012 Abril 2016

Estudios Técnicos

Centro de estudios Carrera Fecha de Inicio Fecha de fin

Estudios académicos y/o técnicos superiores en curso

Centro de estudios Carrera Tipo de estudios Fecha de inicio

Formación Complementaria

Centro de estudios Capacitación complementaria Frecuencia Cantidad País de estudio Fecha de inicio Fecha fin
ICGEB MOLECULAR BIOLOGY OF LEISHMANIA DIAS 4 Italia Octubre 2014 Octubre 2014
ICGEB MOLECULAR BIOLOGY OF LEISHMANIA DIAS 4 Italia Octubre 2014 Octubre 2014
UNIVERSIDAD PERUANA CAYETANO HEREDIA DIPLOMADO EN INFORMATICA BIOMEDICA MESES 4 Perú Enero 2012 Abril 2012
ICGEB MOLECULAR BIOLOGY OF LEISHMANIA DIAS 4 Italia Octubre 2010 Octubre 2010
WELLCOME TRUST SANGER INSTITUTE WORKING WITH PATHOGEN GENOMES DIAS 5 Inglaterra Diciembre 2012 Diciembre 2012
AMERICAN SOCIETY OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE AMERICAN SOCIETY OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE ANNUAL MEETING DIAS 5 Estados Unidos Noviembre 2011 Noviembre 2011

Idiomas

Idioma Lectura Conversación Escritura Forma de aprendizaje Lengua Materna
FRANCES AVANZADO INTERMEDIO INTERMEDIO Estudio Instituto NO
INGLES AVANZADO SUPERIOR AVANZADO SUPERIOR AVANZADO SUPERIOR Estudio Instituto NO
PORTUGUES AVANZADO AVANZADO INTERMEDIO Otros NO

Línea de investigación

Área Sub área Disciplina Temática Ambiental Temática Médica y de la Salud
Ciencias Médicas y de la Salud Ciencias de la Salud Parasitología
Ciencias Médicas y de la Salud Ciencias de la Salud Medicina tropical
Ciencias Médicas y de la Salud Biotecnología en Salud Biotecnología relacionada con la salud

Producción científica

Tipo Producción Título Autor Año de Producción DOI Revista Fuente Cuartil de ScimagoJR o JCR*
Journal-article Malaria Molecular Surveillance in the Peruvian Amazon with a Novel Highly Multiplexed Plasmodium falciparum AmpliSeq Assay. 2023 10.1128/SPECTRUM.00960-22 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Drug resistance and population structure of Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax in the Peruvian Amazon. 2022 10.1038/S41598-022-21028-3 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Spatiotemporal dynamics of Plasmodium falciparum histidine-rich protein 2 and 3 deletions in Peru. 2022 10.1038/S41598-022-23881-8 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Genetic diversity and population structure of Leishmania (Viannia) braziliensis in the Peruvian jungle. 2022 10.1371/JOURNAL.PNTD.0010374 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal - Article Replacement of Leishmania (Leishmania) infantum Populations in an Endemic Focus of Visceral Leishmaniasis in Brazil Valdivia, Hugo O. | Roatt, Bruno M. | Baptista, Rodrigo de Paula | Ottino, Jennifer | Coqueiro-dos-Santos, Anderson | Sanders, Mandy J. | Reis, Alexandre B. | Cotton, James A. | Bartholomeu, Daniella C. 2022 10.3389/FCIMB.2022.900084 FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY 2022: No disponible**, 2020: Q1
Journal-article Field Evaluation of a Hemozoin-Based Malaria Diagnostic Device in Puerto Lempira, Honduras. 2022 10.3390/DIAGNOSTICS12051206 Europe PubMed Central a través de ORCID
Artículo en revista científica Comparison of sand fly trapping approaches for vector surveillance of leishmania and bartonella species in ecologically distinct, endemic regions of peru Zorrilla V.O. 2021 PLoS Neglected Tropical Diseases S/C***
Artículo en revista científica Diagnosis and identification of Leishmania species in patients with cutaneous leishmaniasis in the state of Roraima, Brazils Amazon Region de Almeida J.V. 2021 Parasites and Vectors S/C***
Artículo en revista científica Diversity, distribution and natural leishmania infection of sand flies from communities along the interoceanic highway in the southeastern peruvian amazon Valdivia H.O. 2021 PLoS Neglected Tropical Diseases S/C***
Artículo en revista científica Evidence of a recent bottleneck in plasmodium falciparum populations on the honduran–nicaraguan border Pinto A. 2021 Pathogens S/C***
Artículo en revista científica Field validation of a magneto-optical detection device (Gazelle) for portable point-of-care Plasmodium vivax diagnosis Valdivia H.O. 2021 PLoS ONE S/C***
Artículo en revista científica Laboratory findings in patients with probable dengue diagnosis from an endemic area in Colombia in 2018 Cardenas J.C. 2021 Viruses S/C***
Artículo en revista científica Population genomics and evidence of clonal replacement of Plasmodium falciparum in the Peruvian Amazon Villena F.E. 2021 Scientific Reports S/C***
Artículo en revista científica Validation study of Boil & Spin Malachite Green Loop Mediated Isothermal Amplification (B&S MG-LAMP) versus microscopy for malaria detection in the Peruvian Amazon Barazorda K.A. 2021 PLoS ONE S/C***
Artículo en revista científica Antibody Responses Against Anopheles darlingi Immunogenic Peptides in Plasmodium Infected Humans Londono-Renteria B. 2020 Frontiers in Cellular and Infection Microbiology S/C***
Artículo en revista científica Comparison of real time and malachite-green based loop-mediated isothermal amplification assays for the detection of Plasmodium vivax and P. falciparum Barazorda K.A. 2020 PLoS ONE S/C***
Artículo en revista científica Genomic surveillance of Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax cases at the University Hospital in Tegucigalpa, Honduras Valdivia H.O. 2020 Scientific Reports S/C***
Artículo en revista científica Guaroa Virus and Plasmodium vivax Co-Infections, Peruvian Amazon Siles C. 2020 Emerging Infectious Diseases S/C***
Artículo en revista científica Molecular surveillance of the Plasmodium vivax multidrug resistance 1 gene in Peru between 2006 and 2015 Villena F.E. 2020 Malaria Journal S/C***
Artículo en revista científica Parasitological and molecular diagnosis of cutaneous leishmaniasis among indigenous peoples in the state of Roraima, Brazil de Almeida J.V. 2020 Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical S/C***
Review A cluster of the first reported Plasmodium ovale spp. infections in Peru occuring among returning UN peace-keepers, a review of epidemiology, prevention and diagnostic challenges in nonendemic regions Guerra, Rosio I. 2019 10.1186/s12936-019-2809-8 MALARIA JOURNAL Q1
Article Detection of multiple circulating Leishmania species in Lutzomyia longipalpis in the city of Governador Valadares, southeastern Brazil Cardoso, Mariana Santos 2019 10.1371/journal.pone.0211831 PLoS One Q2
Journal-article Human migration and the spread of malaria parasites to the New World. 2018 10.1038/s41598-018-19554-0 Europe PubMed Central a través de ORCID
Article Whole genome sequencing of Trypanosoma cruzi field isolates reveals extensive genomic variability and complex aneuploidy patterns within TcII DTU Reis-Cunha, Joao Luis 2018 10.1186/s12864-018-5198-4 BMC GENOMICS Q2
Article Exploration of Plasmodium vivax transmission dynamics and recurrent infections in the Peruvian Amazon using whole genome sequencing Cowell, Annie N. 2018 10.1186/s13073-018-0563-0 Genome Medicine Q1
Review Gene and Chromosomal Copy Number Variations as an Adaptive Mechanism Towards a Parasitic Lifestyle in Trypanosomatids Luis Reis-Cunha, Joao 2018 10.2174/1389202918666170911161311 CURRENT GENOMICS Q3
Article Prevalence of and Factors Associated with Negative Microscopic Diagnosis of Cutaneous Leishmaniasis in Rural Peru Lamm, Ryan 2018 10.4269/ajtmh.17-0909 AMERICAN JOURNAL OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE Q2
Journal-article Comparative genomics of canine-isolated Leishmania (Leishmania) amazonensis from an endemic focus of visceral leishmaniasis in Governador Valadares, southeastern Brazil. 2017 10.1038/srep40804 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Distribution and identification of sand flies naturally infected with Leishmania from the Southeastern Peruvian Amazon. 2017 10.1371/journal.pntd.0006029 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Selective Whole-Genome Amplification Is a Robust Method That Enables Scalable Whole-Genome Sequencing of Plasmodium vivax from Unprocessed Clinical Samples. 2017 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article TipMT: Identification of PCR-based taxon-specific markers. 2017 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Chromosomal copy number variation reveals differential levels of genomic plasticity in distinct Trypanosoma cruzi strains. 2015 10.1186/s12864-015-1680-4 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Comparative genomic analysis of Leishmania (Viannia) peruviana and Leishmania (Viannia) braziliensis. 2015 10.1186/s12864-015-1928-z Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article The Leishmania metaphylome: a comprehensive survey of Leishmania protein phylogenetic relationships. 2015 10.1186/s12864-015-2091-2 Europe PubMed Central a través de ORCID
Journal-article Natural Leishmania infection of Lutzomyia auraensis in Madre de Dios, Peru, detected by a fluorescence resonance energy transfer-based real-time polymerase chain reaction. 2012 10.4269/ajtmh.2012.11-0708 Europe PubMed Central a través de ORCID

* Sólo se presentan los cuartiles para la producción tipo artículos y review.

** Cuartil no disponible para el año de la publicación.

*** La revista no tiene cuartil en el año de la publicación.


Otras Producciones

Tipo de Producción Título Año de Producción Título de la fuente
ARTÍCULO EN CONGRESO Genetic Diversity in Leishmania (Viannia) braziliensis from an Outbreak of Cutaneous Leishmaniasis: Potential Clinical and Epidemiological Implications 2013 Fifth World Congress on Leishmaniasis, 2013, Portho de G...
ARTÍCULO EN CONGRESO Natural Leishmania Infection in Sandflies from the Southern Peruvian Amazon Basin 2013 Fifth World Congress on Leishmaniasis, 2013, Porto de Ga...
ARTÍCULO EN CONGRESO New Carrier of Leishmania Species Identified by Real Time PCR in Madre de Dios – Peru 2011 American Society of Tropical Medecine and Hygiene 60th ...
RESUMEN DE CONGRESO Evidence of selection and gene copy number variations in virulence factors and resistance genes in Plasmodium falciparum from Loreto - Peru 2016
CARTEL DE CONFERENCIA/POSTER The Leishmania metaphylome: a comprehensive survey of Leishmania protein phylogenetic relationships 2016
ARTÍCULO EN CONGRESO Comparative genomic analysis between Leishmania (Viannia) peruviana and Leishmania (V.) braziliensis 2015

Proyectos de Investigación

Tipo Proyecto Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha Fin Inv. Principal Área OCDE
Proyectos de investigación Surveillance of Chagas Disease and Trypanosoma cruzi Infections in the SOUTHCOM Area of Responsibility 1. To collect 90% of target samples from El Salvadorian military at the Central military Hospital. 2. To estimate the seroprevalence of Trypanosoma cruzi in samples from El Salvador, Colombia and Peru as the COVID-19 crisis permits. 3. To genotype at least 50% of the proposed target from all collected samples in FY22. 4. To identify and report high-risk areas for Chagas transmission in El Salvador, Colombia and Peru. CENTRO DE INVESTIGACIÓN DE ENFERMEDADES TROPICALES DE LA MARINA DE LOS EEUU (NAMRU-6) Octubre 2020 Setiembre 2021 HUGO OSWALDO VALDIVIA RODRIGUEZ
Proyectos de investigación Malaria surveillance in Central and South America i) Collect clinical specimens in Peru, Colombia, Brazil and Honduras, ii) determine the prevalence of PfHRP2 and PfHRP3 gene deletions and iii) perform NGS drug resistance genotyping CENTRO DE INVESTIGACIÓN DE ENFERMEDADES INFECCIOSAS DE LA MARINA DE LOS ESTADOS UNIDOS (NAMRU6) Octubre 2021 Setiembre 2023 HUGO OSWALDO VALDIVIA RODRIGUEZ

Proyectos importados de ORCID

Tipo de financiamiento Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha de Fin

Derechos de Propiedad Intelectual

Título de la Propiedad Intelectual (PI) Tipo de PI Entidad donde se tramitó la PI País Nombre del propietario de la PI Trámite vía PCT Estado de la patente Número de registrode la PI Rol de participación Participación en los derechos de la PI

Productos de Desarrollo Industrial

Denominación Tipo de desarrollo Tipo de participación Estado del desarrollo Alcance del desarrollo Estado del uso del desarrollo Propietario del desarrollo

Distinciones y Premios

Institución Distinción Descripción País Web Referencia
U.S. NAVAL MEDICAL RESEARCH UNIT 6 - NAMRU 6 Extra Mile Award Reconocimiento a la iniciativa y trabajo esforzado estableciendo colaboraciones para desarrollo de proyectos de investigación con científicos internacionales en el área de leishmania. PERÚ
AMERICAN SOCIETY OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE (ASTMH) Young Investigator Award Ganador del Young Investigator Award por el trabajo: Comparative genomic analysis of Leishmania (Viannia) peruviana and Leishmania (Viannia) braziliensis. BMC Genomics ESTADOS UNIDOS http://www.astmh.org/Young_Investigator_Award.htm
AMERICAN SOCIETY OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE (ASTMH) Travel Award Travel award para financiamiento de viajes, hospedaje y gastos de estadia durante el ASTMH 2015 ESTADOS UNIDOS http://www.astmh.org/Student_Travel_Scholarships.htm
US EMBASSY IN PERU Certificate of Appreciation Reconocimiento por el trabajo realizado junto con la UNMSM en el proyecto ganador para la creación del primer Centro de Excelencia del Peru PERÚ
US EMBASSY IN PERU La Encalada, Santiago de Surco Certificate of appreciation: En reconocimiento a la labor realizada durante la investigación de un brote de leishmaniosis en 300 soldados peruanos PERÚ
GLOBAL EMERGING INFECTIONS SURVEILLANCE (GEIS) Letter of appreciation Letter to recognize participation as a Scientific Review Board member in reviewing the FY23 portfolio of submitted extension, pilot and provisional proposals. ESTADOS UNIDOS
UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS Best doctoral thesis at the Bioinformatics program from 2016-2017 BRASIL
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