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Ficha CTI Vitae
ABANTO MARIN MICHEL FRANCISCO

Investigador en el área de Genómica de Microorganismos, Actualmente trabaja en el Núcleo Científico BIOREN de la Universidad de La Frontera (Chile). Posee experiencia en Genómica de microorganismos y bioinformática.

Fecha de última actualización: 31-01-2022


Scopus Author Identifier: 50161970000
Web of Science ResearcherID: null

Datos Personales

    Fuente
Apellidos : ABANTO MARIN
Nombres: MICHEL FRANCISCO
Género: MASCULINO
Nacionalidad: PERÚ

Datos Actuales

Pagina web personal: http://
Pais de residencia: Chile

Experiencia Laboral

Institución Cargo Descripción del cargo Cargo en I+d+i Fecha Inicio Fecha Fin
BIOREN, UNIVERSIDAD DE LA FRONTERA DOCENTE INVESTIGADOR Docente Investigador Julio 2017 A la actualidad
INSTITUTO OSWALDO CRUZ - FUNDAÇÃO OSWALDO CRUZ INVESTIGADOR Post Doctor Otros cargos relacionados a (I+D+i) Junio 2009 Junio 2018
UNIVERSITY OF BATH, INGLATERRA INVESTIGADOR ASOCIADO Otros cargos relacionados a (I+D+i) Setiembre 2016 Junio 2017
INSTITUTO OSWALDO CRUZ Mayo 2009 Setiembre 2012

Experiencia Laboral como Docente

Institución Tipo Institución Tipo Docente Descripción del cargo Fecha Inicio Fecha Fin

Experiencia como Asesor de Tesis

Universidad Tesis Tesista(s) Repositorio Fecha Aceptación de Tesis

Experiencia como evaluador y/o formulador de proyectos

Tipo de experiencia Ańo Tipo de proyecto Entidad financiadora Nombre del concurso Metodología de evaluación Monto proyecto (USD)

Formación Académica (Fuente: SUNEDU)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fuente

Formación Académica (Fuente: Manual)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fecha de inicio Fecha fin Fuente
DOCTORADO PHD/BIOLOGIA COMPUTACIONAL Y SISTEMAS BRASIL Mayo 2009 Mayo 2013
DOCTORADO PHD/BIOLOGIA COMPUTACIONAL Y SISTEMAS BRASIL Mayo 2009 Abril 2013
LICENCIADO / TÍTULO BIÓLOGO - MICROBIÓLOGO UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO PERÚ Enero 2003 Enero 2004
MAGISTER MAGISTER EN BIOLOGÍA MOLECULAR UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS PERÚ Enero 2007 Enero 2008
BACHILLER BACHILLER EN CIENCIAS BIOLÓGICAS UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO PERÚ Enero 1999 Enero 2003

Estudios Técnicos

Centro de estudios Carrera Fecha de Inicio Fecha de fin

Estudios académicos y/o técnicos superiores en curso

Centro de estudios Carrera Tipo de estudios Fecha de inicio

Formación Complementaria

Centro de estudios Capacitación complementaria Frecuencia Cantidad País de estudio Fecha de inicio Fecha fin

Idiomas

Idioma Lectura Conversación Escritura Forma de aprendizaje Lengua Materna

Línea de investigación

Área Sub área Disciplina Temática Ambiental Temática Médica y de la Salud
Ciencias Médicas y de la Salud Biotecnología en Salud Tecnología para la identificación y funcionamiento del ADN, proteínas y enzimas y como influencian la enfermedad)
Ciencias Naturales Computación y ciencias de la información Ciencias de la información y bioinformática
Ciencias Naturales Ciencias biológicas Bioquímica y biología molecular
Ciencias Naturales Ciencias biológicas Biología celular y microbiología

Producción científica

Tipo Producción Título Autor Año de Producción DOI Revista Fuente Cuartil de ScimagoJR o JCR*
JOURNAL_ARTICLE Complete genome sequence of Shewanella algae strain 2NE11, a decolorizing bacterium isolated from industrial effluent in Peru 2022 10.1016/j.btre.2022.e00704 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genome Sequences of 408 SARS-CoV-2 Strains Obtained from Nasopharyngeal Swabs in La Araucanía Region, Southern Chile 2022 10.1128/mra.00121-22 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Beyond to the Stable: Role of the Insertion Sequences as Epidemiological Descriptors in Corynebacterium striatum 2022 10.3389/fmicb.2022.806576 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Potential applications of CRISPR/Cas for next-generation biomonitoring of harmful algae blooms: A review 2021 10.1016/j.hal.2021.102027 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Comparative genomic analysis of two novel plasmids from Acidithiobacillus ferrivorans strain PQ33 2021 10.15381/rpb.v28i1.19743 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genetic patterns found in the nuclear localization signals (Nlss) associated with ebv-1 and ebv-2 provide new insights into their contribution to different cell-type specificities 2021 10.3390/cancers13112569 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genetic Patterns Found in the Nuclear Localization Signals (NLSs) Associated with EBV-1 and EBV-2 Provide New Insights into Their Contribution to Different Cell-Type Specificities 2021 10.3390/cancers13112569 Multidisciplinary Digital Publishing Institute a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Treat Me Well or Will Resist: Uptake of Mobile Genetic Elements Determine the Resistome of <i>Corynebacterium striatum</i> 2021 10.3390/ijms22147499 Multidisciplinary Digital Publishing Institute a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Strategy for biological co-production of levulinic acid and polyhydroxyalkanoates by using mixed microbial cultures fed with synthetic hemicellulose hydrolysate 2020 10.1016/j.biortech.2020.123323 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Global Expansion of Pacific Northwest <i>Vibrio parahaemolyticus</i> Sequence Type 36 2020 10.3201/eid2602.190362 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Landscape of genome-wide dna methylation of colorectal cancer metastasis 2020 10.3390/cancers12092710 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Antarctic Streptomyces fildesensis So13.3 strain as a promising source for antimicrobials discovery 2019 10.1038/s41598-019-43960-7 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE A reliable Epstein-Barr Virus classification based on phylogenomic and population analyses 2019 10.1038/s41598-019-45986-3 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Functional and transcriptomic characterization of carboplatin-resistant A2780 ovarian cancer cell line 2019 10.1186/s40659-019-0220-0 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Mansonella ozzardi mitogenome and pseudogene characterisation provides new perspectives on filarial parasite systematics and CO-1 barcoding 2018 10.1038/s41598-018-24382-3 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil 2018 10.1590/0074-02760180051 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Epidemic Dynamics of<i>Vibrio parahaemolyticus</i>Illness in a Hotspot of Disease Emergence, Galicia, Spain 2018 10.3201/eid2405.171700 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica A one-step multiplex PCR to identify Klebsiella pneumoniae, Klebsiella variicola, and Klebsiella quasipneumoniae in the clinical routine Fonseca E. 2017 10.1016/j.diagmicrobio.2017.01.005 Diagnostic Microbiology and Infectious Disease Q1
JOURNAL_ARTICLE A one-step multiplex PCR to identify Klebsiella pneumoniae, Klebsiella variicola, and Klebsiella quasipneumoniae in the clinical routine 2017 10.1016/j.diagmicrobio.2017.01.005 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica The invasive MenC cc103 lineage with penicillin reduced susceptibility persisting in Brazil Fonseca É. 2017 10.1016/j.ijmm.2017.05.004 International Journal of Medical Microbiology Q1
JOURNAL_ARTICLE The invasive MenC cc103 lineage with penicillin reduced susceptibility persisting in Brazil 2017 10.1016/j.ijmm.2017.05.004 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Physiological and comparative genomic analysis of Acidithiobacillus ferrivorans PQ33 provides psychrotolerant fitness evidence for oxidation at low temperature 2017 10.1016/j.resmic.2017.01.007 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE The invasive Neisseria meningitidis MenC CC103 from Brazil is characterized by an accessory gene repertoire 2017 10.1038/s41598-017-01671-x Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica The invasive Neisseria meningitidis MenC CC103 from Brazil is characterized by an accessory gene repertoire Marin M. 2017 10.1038/s41598-017-01671-x Scientific Reports Q1
JOURNAL_ARTICLE Genomic Variation and Evolution of <i>Vibrio parahaemolyticus</i> ST36 over the Course of a Transcontinental Epidemic Expansion 2017 10.1128/mbio.01425-17 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica Complete plasmid sequence carrying type IV-like and type VII secretion systems from an atypical mycobacteria strain Morgado S. 2017 10.1590/0074-02760160546 Memorias do Instituto Oswaldo Cruz Q1
JOURNAL_ARTICLE Complete plasmid sequence carrying type IV-like and type VII secretion systems from an atypical mycobacteria strain 2017 10.1590/0074-02760160546 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica Genomic variation and evolution of vibrio parahaemolyticus ST36 over the course of a transcontinental epidemic expansion Martinez-Urtaza J. 2017 mBio S/C***
Artículo en revista científica Physiological and comparative genomic analysis of Acidithiobacillus ferrivorans PQ33 provides psychrotolerant fitness evidence for oxidation at low temperature Ccorahua-Santo R. 2017 Research in Microbiology S/C***
Artículo en revista científica The mitogenome of Onchocerca volvulus from the Brazilian Amazonia focus Crainey J. 2016 10.1590/0074-02760150350 Memorias do Instituto Oswaldo Cruz Q1
JOURNAL_ARTICLE The mitogenome of Onchocerca volvulus from the Brazilian Amazonia focus 2016 10.1590/0074-02760150350 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Phylogenetic analyses of chikungunya virus among travelers in Rio De Janeiro, Brazil, 2014-2015 2016 10.1590/0074-02760160004 Scopus - Elsevier a través de ORCID
Artículo en revista científica Phylogenetic analyses of chikungunya virus among travelers in Rio De Janeiro, Brazil, 2014-2015 Conteville L. 2016 10.1590/0074-02760160004 Memorias do Instituto Oswaldo Cruz Q1
JOURNAL_ARTICLE Full characterization of the integrative and conjugative element carrying the metallo-β-lactamase blaSPM-1 and bicyclomycin bcr1 resistance genes found in the pandemic Pseudomonas aeruginosa clone SP/ST277 2015 10.1093/jac/dkv152 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genomic analysis of a nontoxigenic, invasive corynebacterium diphtheriae strain from Brazil 2015 10.1590/0074-02760150250 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Parvovirus B19 1A complete genome from a fatal case in Brazil 2015 10.1590/0074-02760150261 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genome comparison of an ancestral isolate and a modern isolate of Mycobacterium tuberculosis of the Beijing lineage from São Paulo, Brazil 2015 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica Full characterization of the integrative and conjugative element carrying the metallo-β-lactamase bla SPM-1 and bicyclomycin bcr1 resistance genes found in the pandemic Pseudomonas aeruginosa clone SP/ST277. Fonseca EL 2015 The Journal of antimicrobial chemotherapy No Aplica
Artículo en revista científica Genome Comparison of an Ancestral Isolate and a Modern Isolate of Mycobacterium tuberculosis of the Beijing Lineage from São Paulo, Brazil. Gomes LL 2015 Genome announcements No Aplica
Artículo en revista científica Genomic analysis of a nontoxigenic, invasive Corynebacterium diphtheriae strain from Brazil. Encinas F 2015 Memorias do Instituto Oswaldo Cruz No Aplica
Artículo en revista científica Parvovirus B19 1A complete genome from a fatal case in Brazil. Conteville LC 2015 Memorias do Instituto Oswaldo Cruz No Aplica
JOURNAL_ARTICLE The genome of a clinical<i>Klebsiella variicola</i>strain reveals virulence-associated traits and a pl9-like plasmid 2014 10.1111/1574-6968.12583 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Comparative genomics of 274 Vibrio cholerae genomes reveals mobile functions structuring three niche dimensions 2014 10.1186/1471-2164-15-654 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Worldwide occurrence of integrative conjugative element encoding multidrug resistance determinants in epidemic Vibrio cholerae O1 2014 10.1371/journal.pone.0108728 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Complete genome sequence of a clinical Bordetella pertussis isolate from Brazil 2014 Michel Abanto Marín a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE The genome of a clinical Klebsiella variicola strain reveals virulence-associated traits and a pl9-like plasmid 2014 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica Comparative genomics of 274 Vibrio cholerae genomes reveals mobile functions structuring three niche dimensions. Dutilh BE 2014 BMC genomics No Aplica
Artículo en revista científica Complete genome sequence of a clinical Bordetella pertussis isolate from Brazil. Andrade BG 2014 Memorias do Instituto Oswaldo Cruz No Aplica
Artículo en revista científica The genome of a clinical Klebsiella variicola strain reveals virulence-associated traits and a pl9-like plasmid. Andrade BG 2014 FEMS microbiology letters No Aplica
Artículo en revista científica Worldwide occurrence of integrative conjugative element encoding multidrug resistance determinants in epidemic Vibrio cholerae O1. Marin MA 2014 PloS one No Aplica
JOURNAL_ARTICLE Architecture of the superintegron in Vibrio cholerae: Identification of core and unique genes 2013 10.12688/f1000research.2-63.v1 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Streptococcal taxonomy based on genome sequence analyses 2013 10.12688/f1000research.2-67.v1 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Cholera Outbreaks in Nigeria Are Associated with Multidrug Resistant Atypical El Tor and Non-O1/Non-O139 Vibrio cholerae 2013 10.1371/journal.pntd.0002049 Scopus - Elsevier a través de ORCID
CONFERENCE_PAPER Molecular identification of iron oxidizing bacteria isolated from acid mine drainages in Peru 2013 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica Architecture of the superintegron in Vibrio cholerae: identification of core and unique genes. Marin MA 2013 F1000Research No Aplica
Artículo en revista científica Cholera outbreaks in Nigeria are associated with multidrug resistant atypical El Tor and non-O1/non-O139 Vibrio cholerae. Marin MA 2013 PLoS neglected tropical diseases No Aplica
Conference Paper Molecular identification of iron oxidizing bacteria isolated from acid mine drainages in Peru Abanto M. 2013 Advanced Materials Research No Aplica
Artículo en revista científica Streptococcal taxonomy based on genome sequence analyses. Thompson CC 2013 F1000Research No Aplica
JOURNAL_ARTICLE Variants of Vibrio cholerae O1 El Tor from Zambia showed new genotypes of ctxB 2012 10.1017/S0950268811001944 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Complete genome sequence of central Africa Human T-cell lymphotropic virus subtype 1b 2012 10.1128/JVI.02258-12 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Cloning, expression and bioinformatics analysis of ATP sulfurylase from Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 in Escherichia coli 2012 Michel Abanto Marín a través de ORCID
Artículo en revista científica Cloning, expression and bioinformatics analysis of ATP sulfurylase from Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 in Escherichia coli. Jaramillo ML 2012 Bioinformation No Aplica
Artículo en revista científica Complete genome sequence of Central Africa human T-cell lymphotropic virus subtype 1b. Zanella L 2012 Journal of virology No Aplica
Artículo en revista científica Variants of Vibrio cholerae O1 El Tor from Zambia showed new genotypes of ctxB. Marin MA 2012 Epidemiology and infection No Aplica
JOURNAL_ARTICLE Vibrio cholerae O1 lineages driving cholera outbreaks during seventh cholera pandemic in Ghana 2011 10.1016/j.meegid.2011.08.020 Scopus - Elsevier a través de ORCID
JOURNAL_ARTICLE Genome sequence of the human pathogen Vibrio cholerae Amazonia 2011 10.1128/JB.05643-11 Scopus - Elsevier a través de ORCID
Artículo en revista científica Genome sequence of the human pathogen Vibrio cholerae Amazonia. Thompson CC 2011 Journal of bacteriology No Aplica
Artículo en revista científica Vibrio cholerae O1 lineages driving cholera outbreaks during seventh cholera pandemic in Ghana. Thompson CC 2011 Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases No Aplica
JOURNAL_ARTICLE Identificación molecular de Pichia guillermondii aislada de aguas ácidas de minas en el Perú y su resistencia a metales pesados 2008 Michel Abanto Marín a través de ORCID

* Sólo se presentan los cuartiles para la producción tipo artículos y review.

** Cuartil no disponible para el año de la publicación.

*** La revista no tiene cuartil en el año de la publicación.


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Tipo Proyecto Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha Fin Inv. Principal Área OCDE

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